V poradně jsou diagnostikována a léčena onemocnění trávicího traktu.

Základem práce lékaře v gastroenterologické poradně je detailní zhodnocení pacientových obtíží, jejich intenzity, délky trvání a z toho plynoucích změn. Po rozboru aktuálních problémů a příznaků pacientova předchorobí (anamnézy) následuje zpravidla celkové fyzikální vyšetření a vyšetření zaměřené na postiženou oblast.

Podle nálezů ordinuje gastroenterolog další speciální vyšetření s cílem zjistit přesnou příčinu obtíží a zahájit účinnou léčbu.

Mezi základní vyšetření v gastroenterologii patří  endoskopická vyšetření trávicí trubice (gastroskopie , koloskopie) , vyšetření břicha ultrazvukem a v návaznosti pak cílené laboratorní vyšetření.